Federico Pezzotta è stato, nel periodo 1998-2023, curatore di mineralogia del Museo di Storia Naturale di Milano, in cui nel marzo 2021 ha inaugurato la nuova esposizione permanente della Galleria dei Minerali. Attualmente è direttore del Museo mineralogico e gemmologico intitolato a "Luigi Celleri" all'Isola d'Elba, in Toscana. Nel periodo 2013-2018 è stato Presidente della Commissione IMA-Museo e da marzo 2019 è Presidente del GML-AIM (Gruppo Mineralogico Lombardo - Associazione Italiana di Mineralogia). Dal 2004 fa parte della Sottocommissione IMA sulla Nomenclatura del Supergruppo delle Tormaline.

Nel 2003 gli è stato dedicato il nome del nuovo minerale e nuova gemma pezzottaite, proveniente dal Madagascar.

Come mineralogista e petrologo, interessato soprattutto alle pegmatiti gemmifere, ed esperto di prospezione ed estrazione di campioni di minerali e gemme, Federico ha visitato, studiato ed eseguito lavori sul campo e di consulenza in giacimenti di pegmatiti in Brasile, Italia, Madagascar, Malawi, Mozambico, Myanmar, Nigeria, Ucraina e in varie località degli Stati Uniti. Attualmente è anche partner di imprese minerarie in Madagascar e Mozambico ed è titolare della società M.C.P., con sede a Milano, dedicata alla preparazione di campioni di minerali per musei e collezionisti (www.mcp-italy.com).

Grazie a questa esperienza ha realizzato circa 300 pubblicazioni su riviste internazionali, scientifiche e divulgative.

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